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Identifier une espèce à partir d’un très petit échantillon : c’est possible en analysant son ADN pour le Centre R&D de VEGEPOLYS VALLEY !

Paru le 04-11-2024 |

Le laboratoire du Centre de de R&D de VEGEPOLYS VALLEY vous invite à jouer à "Qui est-ce ?" avec lui 😃... alerte spoiler... le Centre gagne à tous les coups !
Végétaux, micro-organismes, insectes … 🌿🦠🦗 : le Centre R&D est régulièrement sollicité pour de telles analyses.
🧬 Identifier une espèce à partir d’un très petit échantillon, c’est possible en analysant son ADN.

Pour les racines :

L’enjeu est de réaliser des analyses dans le cadre de plusieurs litiges distincts dus dans chacun des cas à des dégâts imputés à des racines.
🏘️👨🏻‍🌾 Les dommages susceptibles d’être occasionnés par les systèmes racinaires des végétaux peuvent concerner de nombreux ouvrages : murs, chapes, réseaux d’eau, piscines, fondations, drains …
Identifier une espèce végétale à partir d’un petit échantillon de racine ? C’est possible au laboratoire via l’ADN ! 🥼

⚠️ Parce que la description et l’identification des espèces végétales reposent majoritairement sur les parties aériennes, identifier un végétal sur la seule base de racines s'avère souvent très difficile.

De plus, d'une part des végétaux très différents peuvent présenter des racines assez similaires ; d'autre part pour une espèce végétale donnée, l'environnement peut affecter l'apparence du système racinaire.

Par ailleurs la présence d’une racine en un site donné ne signifie pas qu’elle provient des végétaux les plus proches géographiquement.

Enfin, dans un litige une suspicion ne constitue pas une preuve.

❓ Comment sont réalisés ces tests ?

L’identification moléculaire par analyse d’ADN🧬 est réalisée par barcoding :
▶️ L’ADN est extrait de la matière végétale ; la technique d’extraction utilisée varie selon le type d’échantillon et sa composition biochimique afin d’obtenir la concentration et la pureté d’ADN nécessaires à l’analyse ;
▶️ L’ADN extrait est analysé en amplifiant des régions spécifiques du génome (bien conservées au cours de l’évolution des espèces) par PCR (Polymerase Chain Reaction) et en séquençant les produits de cette amplification ;
▶️ Les séquences d'ADN ainsi obtenues peuvent être comparées entre plusieurs échantillons, entre échantillon(s) et témoin(s), entre échantillon(s) et séquences publiées sur base de données de référence … ;
▶️ L’identification genre – espèce sera réalisée à partir de l’homologie entre séquences d’ADN.

💡 Quelques autres exemples d’applications ?

Voici différentes enquêtes 🕵️ menées par le Centre R&D pour des entreprises ou des programmes académiques :
➡️ agroalimentaire : identification de fragments afin d’en déterminer l’origine (bois dans légumes transformés)
➡️ cosmétique / complément alimentaire : authentification lors du sourcing de matières premières (végétaux, algues …)
➡️ production : identification et authentification (contrôle qualité)
➡️ collection végétale : identification d’accessions atypiques
➡️ écologie : identification d’espèces (invasives, protégées, nouvellement arrivées …)
➡️ écologie : identification de très petites graines
➡️ agronomie : identification de végétaux à partir de racines seules (drains colmatés)
➡️ diagnostic : identification d’agents pathogènes (maladies)